Hallintoyksikkö,
Tietohallintoyksikkö ja Yhteiset palvelut -yksikkö ohjaavat ja palvelevat omalla vastuualueellaan kaikkia Verohallinnon yksikköjä.
Esikunta- ja oikeusyksikkö, Viestintäyksikkö ja Sisäisen tarkastuksen yksikkö huolehtivat Verohallinnon konsernitoiminnoista.
Harmaan talouden selvitysyksikön tehtävänä on edistää harmaan talouden torjuntaa tuottamalla ja jakamalla tietoa harmaasta taloudesta ja sen torjunnasta. Lisäksi yksikkö laatii selvityksiä yrityksistä ja muista yhteisöistä muille viranomaisille laissa säädettyihin tarkoituksiin.
Veronsaajien oikeudenvalvontayksikkö on muusta Verohallinnosta riippumaton valtakunnallinen yksikkö, joka valvoo veronsaajien oikeutta verotuksessa ja verotusta koskevassa muutoksenhaussa.
Verotustehtäviä hoitavat Henkilöverotusyksikkö, Yritysverotusyksikkö, Veronkantoyksikkö ja Verotarkastusyksikkö. Kullakin on Helsingissä sijaitseva ohjaus- ja kehittämisyksikkö, joka vastaa yksikön toiminnan suunnittelusta, ohjaamisesta ja seurannasta, tietojärjestelmistä, kotimaisesta ja kansainvälisestä sidosryhmäyhteistyöstä sekä hankkeista. Varsinaiset verotustehtävät hoidetaan eri puolella Suomea sijaitsevissa toimintayksiköissä.